Molecola del Mese
di David Goodsell
trad di Mauro Tonellato

FoxP3



Molecola del mese di dicembre 2025
La proteina FoxP3 è il principale regolatore della tolleranza immunitaria e agisce modulando la trascrizione del DNA

Introduzione
Il sistema immunitario agisce sulla lama di un rasoio. Deve difendere l'organismo da un'enorme varietà di agenti estranei, dai batteri patogeni ai virus.
Allo stesso tempo, deve agire con moderazione, evitando di attaccare le cellule e le molecole dell'organismo stesso, un processo noto come auto-tolleranza.
Le cellule fondamentali per questo equilibrio immunologico sono i linfociti T regolatori, o Treg. I Treg agiscono come guardiani del sistema immunitario sopprimendo i leucociti autoreattivi e modulando la risposta immunitaria di una vasta gamma di altre cellule immunitarie.
In assenza dei Treg, il sistema immunitario può attaccare i propri stessi tessuti, causando malattie e infiammazioni croniche.
Per le loro scoperte riguardanti i Treg, Mary Brunkow, Fred Ramsdell e Shimon Sakaguchi hanno ricevuto il Premio Nobel per la Fisiologia o la Medicina nel 2025.

Un orchestratore delle reti trascrizionali
Lo sviluppo e la funzione dei Treg sono controllati dal fattore di trascrizione Forkhead box protein P3 (FoxP3), un importante regolatore della trascrizione del DNA che controlla l'espressione di numerosi geni.
FoxP3 appartiene a una famiglia di fattori di trascrizione che condividono un motivo proteico chiamato dominio "forkhead box". È stato dimostrato che questo dominio si lega al DNA in modo strutturalmente simile all'istone linker H5. Come mostrato nella figura qui sopra, il dominio forkhead box di FoxP3 può legare il DNA in diversi modi: come coppia testa-a-testa (PDB 7TDW e 7TDX) oppure come dimero con domini invertiti, capace di collegare due filamenti di DNA (PDB 3QRF).
Altri domini di FoxP3 (non mostrati in figura) includono un dominio a dita di zinco (mdm 3-2007) e un dominio a cerniera di leucina, importanti per l'oligomerizzazione e per l'interazione con una vasta gamma di partner regolatori.

Regolazione dell'organizzazione del DNA a lungo raggio
Studi biochimici hanno mostrato che FoxP3 può interagire con diversi partner per formare un grande complesso costituito da centinaia di fattori. Questi includono ulteriori fattori di trascrizione e proteine coinvolte nel rimodellamento epigenetico, come metiltransferasi e deacetilasi.
È stato dimostrato che la composizione dei complessi FoxP3 è dinamica e cambia in risposta ai segnali intracellulari e agli stimoli ambientali.
Recenti studi strutturali stanno chiarendo come si formano questi ampi complessi contenenti FoxP3.
Più copie di FoxP3 possono legare segmenti ripetuti di DNA noti come microsatelliti, formando lunghi polimeri.
I polimeri di FoxP3 possono quindi associarsi tra loro in vari modi attraverso i domini forkhead, originando multimeri di ordine superiore altamente stabili che riuniscono più filamenti di DNA (come mostrato qui a fianco con 4 filamenti, PDB 9D2L). I ricercatori ipotizzano che questi ponti grandi e flessibili di DNA mediati da FoxP3 svolgano un ruolo importante nella stabilizzazione degli avvolgimenti di DNA in migliaia di siti genetici distribuiti nel genoma, modellando così la trascrizione su scala globale nelle cellule Treg.

IPEX: una malattia devastante
La perdita o la disfunzione di FoxP3 causa una patologia nota come sindrome IPEX (Immune dysregulation, Poly-endocrinopathy, Enteropathy, X-linked).
IPEX è una malattia gravissima e spesso letale, che si manifesta come un insieme di disturbi autoimmuni che colpiscono organi in tutto il corpo.
Oltre 70 mutazioni di FoxP3 possono causare IPEX. Molte di esse si trovano nel dominio forkhead box e compromettono la stabilità di FoxP3 e il suo legame col DNA o con altri partner proteici.











Un'altra immagine ottenuta con Chimera del complesso con quattro filamenti di DNA è mostrato qui a lato (PDB 9D2L).










































Esplorando la struttura
Nell'immagine qui a lato, alcune delle mutazioni nel dominio forkhead box di FoxP3 (PDB 7TDW) che possono portare alla sindrome IPEX sono evidenziate in giallo.



























Nella immagine qui a lato (realizzata con Chimera) si vede come la proteina FoxP3 (rossa) riconosca la giusta posizione nel DNA inserendo una sua alfa elica nella scanalatura maggiore del DNA. In questo modo, le basi azotate non vengono riconosciute frontalmente (dove si accoppiano con le basi della catena complementare), ma di fianco.

































Spunti per ulteriori esplorazioni
Oltre al dominio forkhead box, FoxP3 possiede anche un dominio a dita di zinco (mdm 3-2007).
Vedi altri fattori di trascrizione, come Oct e Sox (mdm 4-2009), e i recettori nucleari, inclusi il recettore degli estrogeni (mdm 9-2003), il recettore dei glucocorticoidi (mdm 6-2021) e il recettore della vitamina D (mdm 11-2012).
Informati sugli interferoni (-2010), proteine coinvolte nella difesa immunitaria innata.
Esplora altri lavori premiati con il Nobel presenti nel PDB.

Bibliografia
7TDW, 7TDX: Leng F, Zhang W, Ramirez RN, Leon J, Zhong Y, Hou L, Yuki K, van der Veeken J, Rudensky AY, Benoist C, Hur S. The transcription factor FoxP3 can fold into two dimerization states with divergent implications for regulatory T cell function and immune homeostasis. Immunity. 2022 Aug 9;55(8):1354-1369.e8.
3QRF: Bandukwala HS, Wu Y, Feuerer M, Chen Y, Barboza B, Ghosh S, Stroud JC, Benoist C, Mathis D, Rao A, Chen L. Structure of a domain-swapped FOXP3 dimer on DNA and its function in regulatory T cells. Immunity. 2011 Apr 22;34(4):479-91. Erratum in: Immunity. 2011 Apr 22;34(4):627.
9D2L: Leng F, Merino-Urteaga R, Wang X, Zhang W, Ha T, Hur S. Ultrastable and versatile multimeric ensembles of FoxP3 on microsatellites. Mol Cell. 2025 Apr 17;85(8):1509-1524.e7.
Zhang W, Leng F, Wang X, Ramirez RN, Park J, Benoist C, Hur S. FoxP3 recognizes microsatellites and bridges DNA through multimerization. Nature. 2023 Dec;624(7991):433-441.

 

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