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Pompe di tipo P
La pompa sodio-potassio (mostrata qui dal file PDB
2zxe) appartene alla grande classe di pompe
di tipo P ATP dipendenti così chiamate perché incorporano
un intermedio legato al fosfato (P) nel loro meccanismo. Negli archivi
PDB sono disponibili molti altri tipi di pompe ioniche. Ci sono molte
strutture di pompa del calcio come il file PDB 1su4
illustrato qui, che mostra come queste pompe subiscono grandi deformazioni
durante il loro ciclo di pompaggio. Altri esempi sono le pompe di protoni
che si trovano nelle membrane cellulari delle piante (file PDB 3b8c)
e una pompa protone-potassio che acidifica lo stomaco (file PDB
3ixz, non mostrata qui). La pompa di protoni
e quella del calcio sono entrambe composte da una singola catena,
mentre le pompe che trasportano potassio hanno di solito una seconda
catena più piccola che qui è mostrata in azzurro. La
struttura della pompa sodio-potassio ha anche una terza catena,
che ha funzioni regolatorie, mostrata qui in viola.
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