Molecola del Mese
di David S. Goodsell
e Mauro Tonellato
Hsp90
Indice 2008

 PianetaChimica



Esplorando la Struttura
Il primo farmaco scoperto capace di attaccare Hsp90 è stata una molecola di origine naturale, geldanamicina, prodotta dai batteri Streptomiceti e mostrata qui sopra a destra (file PDB 1yet). La geldanamicina si lega nel sito di legame dell'ATP della proteina Hsp90 e ne impedisce il legame con l'ATP e così rende impossibile il grande cambiamento conformazionale necessario per generare la forma attiva di Hsp90.
Nell'immagine sulla sinistra si può vedere la proteina Hsp90 con ATP legato correttamente nel sito di legame (file PDB 1am1). Nella molecola di ATP sono presenti solo due dei tre gruppi fosfato, il terzo non è stato registrato perché era troppo mobile.
Sfortunatamente la geldanamicina si è dimostrata così tossica da non poter essere utilizzata come farmaco anticancro, nel frattempo, però, sono stati individuati molti altri composti promettenti. La ricerca, quindi, continua.

Spunti per continuare l'Esplorazione
Provate ad individuare negli archivi PDB altre strutture proteiche che abbiano un farmaco legato al loro interno.
La geldanamicina sembra molto diversa dall'ATP, ma i suoi punti di contatto con il sito di legame della proteina sono molto simili. Sapete individuare gli amminoacidi del sito di legame che interagiscono direttamente con ATP e geldanamicina?


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