Molecola del Mese
di David S. Goodsell
e Mauro Tonellato
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Molecola del Mese di David S. Goodsell e Mauro Tonellato |
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 Codificare per il Selenio Il fattore di allungamento SelB è la proteina che decide quando bisogna introdurre una selenocisteina in corrispondenza di un codone UGA invece di arrestare la sintesi proteica. SelB sa riconoscere una speciale "sequenza di inserimento della selenocisteina" che si trova oltre il codone UGA e forma un caratteristico tratto a forma di forcina nell'RNA messaggero. Il file PDB 1wb1, mostrato sulla sinistra, rappresenta il fattore di allungamento SelB. La grande porzione in alto lega GTP (arancione) e trasporta il complesso selenocisteina tRNA al ribosoma dove avviene la sintesi proteica. SelB è simile al fattore di allungamento Tu che trasporta gli altri venti complessi amminoacido tRNA. SelB possiede inoltre una coda flessibile in grado di legarsi alla sequenza di inserimento della selenocisteina dell'RNA messaggero. La struttura sulla destra (file PDB 2uwm) mostra il legame tra la coda flessibile di SelB e l'RNA messaggero (in arancione e beige). La proteina SelB riconosce una particolare base azotata, una guanina, che sporge dalla catena e riconosce inoltre la forma complessiva del tratto a forcina. Per vedere i dettagli atomici di questo riconoscimento, consultate questa pagina su Proteopedia. 
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del Mese - Indice completo 
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