Molecola del Mese
di David S. Goodsell
Trad. di Mauro Tonellato
Dimeri di Timina
Correzione
degli ErroriDato che passiamo molto tempo all'aria aperta esposti ai raggi del sole, non è sorprendente che abbiamo un meccanismo molto efficace per correggere questi problemi. Le nostre cellule usano una tecnica chiamata riparazione di nucleotidi per escissione che richiede il lavoro combinato di molte proteine per riconoscere le basi rovinate, per eliminare il tratto di DNA con l'errore e infine per costruire una nuova copia del tratto danneggiato.
Alcuni organismi hanno anche altri metodi di correzione, come l'enzima fotoliasi che rompe i legami che tengono unite le due basi azotate del dimero (stranamente utilizza la luce visibile per innescare il processo), oppure l'enzima endonucleasi che elimina i nucleotidi danneggiati da un singolo filamento di DNA e così rende possibile ricostruire la sequenza corretta usando l'altra catena come stampo.
L'endonucleasi mostrata qui, dal file PDB 1vas, stranamente non riconosce direttamente il dimero di timina. Nella figura si può vedere che il dimero di timina (colorato in magenta) non tocca per niente l'enzima. Invece, l'enzima riconosce una delle due adenine appaiate con il dimero. Nel punto danneggiato, infatti, l'accoppiamento delle basi azotate adenina-timina è compromesso dalla forma contorta del dimero, quindi l'adenina può essere piegata in fuori con facilità e portata nel sito attivo dell'enzima. Il tratto di catena con il dimero di timina risulta così libero e può essere tagliato e ricostruito.
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