Molecola del Mese
di David S. Goodsell
Trad. di Mauro Tonellato

Acido Grasso Sintasi

Indice 2007

PianetaChimica

Esplorando la Struttura
La catena in crescita di un acido grasso può essere osservata in molte strutture di proteina trasportatrice di acili, la proteina che, nei batteri e nelle piante, trasporta l'acido grasso da un enzima all'altro. La proteina trasportatrice di acili ha uno speciale coenzima legato ad un amminoacido di serina chiamato fosfopanteteina, una molecola derivata dell'acido pantotenico, o vitamina B5, e che è anche contenuta nel Coenzima A, un altro importante trasportatore di acili, vedi figura a fondo pagina.
Il coenzima pantoteteina è mostrato nella parte alta della figura con i colori standard degli atomi.
Si tratta di una struttura lunga e flessibile che consente all'acido grasso di potersi sempre infilare nel sito attivo dei vari enzimi. Quando non è attaccata ad un enzima, la catena di atomi di carbonio (mostrata in magenta) è protetta all'interno di una profonda tasca nella proteina trasportatrice di acili (la catena proteica è mostrata in marroncino).
Qui sono illustrate due strutture, una con la catena dell'acido grasso in crescita lunga quattro atomi di carbonio (a sinistra, file PDB 1l01), l'altra con la catena lunga dieci atomi di carbonio (a destra, file PDB 2fae). Negli archivi PDB si possono anche trovare strutture di proteina trasportatrice di acili che contengono catene di lunghezza diversa, o anche strutture prive di acido grasso legato.

Queste figure sono state create con RasMol (Chime) (vedi Chimica al Computer). Anche voi potete creare immagini simili seguendo questa procedura: cliccate sui codici di accesso PDB qui sopra per scaricare il file compresso (zip) della proteina, decomprimetelo e poi lanciatelo con Internet Explorer. Se avete installato Chime, potete scegliere nel menù Display le opzioni di visualizzazione che desiderate.

Ecco le molecole di acido pantotenico (vitamina B5) e della fosfopanteteina (un suo derivato). Questa molecola è così efficace come trasportatore di acili che costituisce anche la parte terminale del Coenzima A, il coenzima che trasporta acido acetico sotto forma di acetil-CoA.

Per vedere alcune delle pubblicazioni utilizzate per scrivere questa Molecola del Mese, cliccate qui.

Un elenco di tutte le strutture collegate con "Acido Grasso Sintasi" presenti negli archivi PDB fino al 1 giugno 2007 è disponibile qui.
Indietro: Sintesi a Stadi


Molecola del Mese - Indice completo

PianetaChimica home