Molecola del Mese di David S. Goodsell Trad. di Mauro Tonellato

Citocromo p450

Indice 2006

Esplorando la Struttura
Il citocromo p450 più studiato è un enzima batterico che aggiunge ossigeno alla canfora. Due strutture di questo enzima sono illustrate qui.
La struttura sulla sinistra (file PDB 3cpp) mostra un enzima avvelenato con monossido di carbonio CO. Notate che, al posto dell'ossigeno O2, sull'atomo di ferro (grossa sfera arancione al centro dell'eme) è legata una molecola di monossido di carbonio. La molecola di canfora, legata subito sopra l'eme, non può quindi reagire con l'ossigeno. Questo ci permette di osservare la molecola di canfora nel sito attivo prima che avvenga la reazione con l'ossigeno.
La struttura sulla destra (file PDB 1noo) illustra un enzima normale e mostra la canfora dopo che ha subito la reazione con l'ossigeno. L'atomo di ossigeno che si è sommato alla canfora è quello rosso che si trova sopra il ferro dell'eme. Il secondo atomo di ossigeno (sull'eme era legato O2) è stato rilasciato come molecola di acqua H2O.
Se cercate negli archivi PDB potete trovare dozzine di strutture di citocromo p450 che mostrano una varietà di molecole diverse legate nel piccolo sito attivo e che mostrano diversi stadi di reazione.

Queste figure sono state create con Rasmol (Chime). Anche voi potete realizzare immagini simili cliccando sui codici di accesso qui sopra e scegliendo una delle opzioni nel menù Display.

Un elenco di tutte le strutture correlate con il citocromo p450 presenti nel PDB fino al 1 ottobre 2006 è disponibile qui.
Per ulteriori approfondimenti sul citocromo p450 cliccate qui.

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