Molecola del Mese
di David S. Goodsell
Trad. di Mauro Tonellato
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Molecola del Mese di David S. Goodsell Trad. di Mauro Tonellato |
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AAA+
ATPasi
La pompa per le proteine della HSLUV è costituita
da un anello di sei subunità che circondano un canale centrale. Come
si può vedere nelle due strutture mostrate qui a destra in alto (file
PDB 1yyf e 1g3i),
questi anelli possono cambiare di molto le loro dimensioni e per questo utilizzano
ATP.
Una proteasi simile, CLPXP, utilizza da 30 a 80 molecole di ATP (a seconda di
quanto stabile è la proteina) per spingere una catena di 100 amminoacidi
attraverso il suo canale centrale.
Le ATPasi ad anello, chiamate AAA+ (ATPasi Associate con Attività
cellulari), sono molto comuni nelle cellule dove vengono usate per svolgere
una serie di compiti simili.
Negli archivi PDB sono disponibili molte proteasi di questo tipo, come l'antigene
T del virus Simian 40 (file PDB 1svm) che
svolge la doppia elica del DNA,
il p97 (file PBD 1oz4 o 1r7r)
e il NSF (file PDB 1nsf o 1d2n)
che degradano i complessi proteici coinvolti nel trasporto di membrana.
Anche la dineina, un noto motore proteico, ha una struttura simile alla AAA+
ATPasi per generare il suo movimento.
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Proteasi
