Molecola del Mese di David S. Goodsell Trad. di Mauro Tonellato

Proteina Precursore della beta-Amiloide

Indice 2006

Esplorando la Struttura

Cercando negli archivi PDB si possono trovare strutture del peptide beta-amiloide nelle due sue forme con cui esiste nelle nostre cellule nervose. La figura sulla sinistra (file PDB 1iyt) mostra il peptide nella conformazione con cui interagisce con la membrana. Per la maggior parte è avvolto ad alfa elica formando una struttura più o meno estesa. La figura sulla destra (file PDB 2beg) mostra la struttura della fibrilla amiloide. Migliaia di peptidi si trovano impilati uno sull'altro, ognuno interagisce con i suoi vicini per formare un unico grande foglio beta. Nelle immagini qui sotto le catene proteiche sono rappresentate in modo da rendere più evidente la loro struttura alfa-elica o beta-pieghe. Nell'immagine a sinistra è illustrata la struttura ad alfa-elica del peptide beta-amiloide ottenuta dal file PDB 1iyt. Le due figure sotto a destra mostrano invece la forma che assume il peptide con struttura beta-pieghe (file PDB 2beg). Ogni catena può legarne un'altra lateralmente con legami idrogeno e così si possono impilare migliaia di catene una sull'altra per formare la fibrilla amiloide.

La chiave per comprendere la degenerazione del peptide beta-amiloide e la formazione delle fibrille proteiche amiloidi è proprio nel comprendere l'instabilità della struttura ad alfa-elica che la portano alla transizione verso la struttura beta-pieghe.

Altri esempi di aggregazione patologica beta-pieghe di proteine è quella dell'emoglobina (molecola del mese maggio 2003) che porta all'anemia falciforme e quella dei prioni (Molecola del Mese maggio 2008) che provoca il morbo della mucca pazza.

Queste figure sono state create con RasMol (Chime) (vedi Chimica al Computer). Anche voi potete creare immagini simili seguendo questa procedura: cliccate sui codici di accesso PDB qui sopra per scaricare il file compresso (zip) della proteina, decomprimetelo e poi lanciatelo con Internet Explorer. Se avete installato Chime, potrete vedere le immagini in 3 dimensioni e scegliere nel menù Display le opzioni di visualizzazione che desiderate.

Una lista di tutte le strutture legate alla proteina precursore della beta-amiloide presenti nel PDB fino al 30 giugno 2006 è disponibile qui.
Per ulteriori approfondimenti, ciccate qui.

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