Molecola del Mese
di David S. Goodsell
Trad. di Mauro Tonellato
Alfa-amilasi



Esplorando la Struttura
Il sito attivo dell'alfa-amilasi contiene una terna di amminoacidi acidi (colorati in bianco e rosso) che svolgono la maggior parte del lavoro. Nell'amilasi mostrata qui (file PDB 1ppi) questi amminoacidi sono il glutammato 233, l'aspartato 197, e l'aspartato 300 che lavorano insieme per tagliare il legame tra due zuccheri nella catena di amido. Questa struttura contiene anche una corta catena di cinque unità di glucosio (colorata in giallo) legata nel sito attivo. Il punto che verrà tagliato è mostrato in arancione. Un ione calcio, la grande sfera grigia, si trova lì vicino e stabilizza la struttura dell'enzima. Un ione cloruro, la sfera verde, è legato sotto al sito attivo in molte amilasi, e aiuta la reazione.

Questa figura è stata creata con RasMol (Chime). Anche voi potete creare immagini simili cliccando sui codici di accesso qui sopra e scegliendo una delle opzioni nel menù Display Molecule.

Un elenco di tutte le strutture relative all'alfa-amilasi presenti nel PDB fino al 3 febbraio 2006 è disponibile qui.
Per ulteriori informazioni sulla alfa-amilasi, cliccate qui.


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