Molecola del Mese di David S. Goodsell Trad. di Mauro Tonellato

Molecola del Mese Indice 2005

Molecola del Mese Indice completo

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La "Molecola del Mese" presenta brevi articoli su molecole scelte nel Protein Data Bank (Banca Dati delle Proteine). Ogni pubblicazione comprende un'introduzione alla struttura e alla funzione della molecola, una discussione sull'importanza della molecola per la salute e per il benessere dell'uomo, e suggerimenti su come i visitatori possono vedere da soli le strutture più significative.

La "Molecola del Mese" non è stata concepita per diventare un indice completo delle molecole presenti nel PDB, e nemmeno vuol essere un archivio storico. Le strutture usate per illustrare ogni pubblicazione sono scelte a discrezione dell'autore della "Molecola del Mese".
Qui si possono trovare altre immagini e informazioni sugli articoli pubblicati nella Molecola del Mese.

La traduzione italiana dei testi originali è stata eseguita dal prof. Mauro Tonellato dell'ITIS Natta di Padova e pubblicata qui per gentile autorizzazione dell'autore prof. David S. Goodsell.

Se volete usare queste immagini, siete tenuti ad includere una citazione informativa con i dati corretti, che potete trovare nell'archivio PDB nella pagina che è associata ad ogni struttura. Dovete anche includere un riconoscimento per il creatore delle immagini David S. Goodsell del The Scripps Research Institute

	Fenilalanina Idrossilasi (by D.S. Goodsell and S. Dutta) Gen. 2005 Le proteine che costituiscono pelle, muscoli, capelli, ossa e altri organi del nostro corpo sono essenzialmente delle lunghe catene di amminoacidi legati in sequenza uno all'altro. Esistono 20 diversi amminoacidi e si possono considerare l'alfabeto che compone il linguaggio delle proteine: quando vengono legati in una particolare sequenza, danno vita ad una precisa struttura (una proteina) in grado di svolgere una specifica funzione. Gli amminoacidi sono diversi tra loro per forma, dimensione, polarità, carica elettrica e altre caratteristiche. Alcuni amminoacidi vengono sintetizzati nel nostro corpo a partire dai prodotti di degradazione degli zuccheri e degli acidi grassi, altri vengono sintetizzati a partire da amminoacidi diversi per azione di enzimi specifici. Infine, alcuni di loro, chiamati amminoacidi essenziali, non possono essere sintetizzati nel nostro corpo e li dobbiamo assumere con gli alimenti. La fenilalanina è uno di questi amminoacidi essenziali. [ANCORA...]
	Complesso Maggiore di Istocompatibilità Feb. 2005 I virus sono nemici insidiosi, per questo dobbiamo avere più strategie difensive per combatterli con efficacia. Gli anticorpi sono la nostra prima linea di difesa, si legano ai virus e inducono le cellule del sangue a distruggerli. Ma cosa accade se i virus riescono ad eludere questa difesa ed entrano nelle cellule? A questo punto gli anticorpi non hanno più la possibilità di incontrarli ed i virus sono al sicuro... ma non completamente. Ogni cellula nucleata ha una seconda linea di difesa che usa per segnalare al sistema immunitario che c'è qualche cosa di sbagliato al suo interno. Le cellule eliminano in continuazione le loro vecchie proteine tagliandole in pezzi ed espongono poi alcuni di questi frammenti sulla loro superficie. Questi piccoli peptidi si legano al MHC, il complesso maggiore di istocompatibilità, che trattiene i peptidi e permette al sistema immunitario di esaminarli. [ANCORA...]
	Recettore dei Linfociti-T Mar. 2005 I virus sono uno dei pericoli più grandi che dobbiamo affrontare nella vita di tutti i giorni, per questo il nostro sistema immunitario dispone di tecniche molto efficaci per combatterli. Le nostre cellule chiedono aiuto quando vengono infettate, esponendo piccoli frammenti di proteine virali sulla loro superficie. Quando il sistema immunitario trova questi peptidi virali, uccide immediatamente la cellula infetta e con essa i virus che contiene. Il mese scorso abbiamo visto che una cellula infetta espone i peptidi virali usando l'MHC, il complesso maggiore di istocompatibilità. Questo mese prenderemo in esame il recettore dei linfociti-T, la proteina che riconosce questi peptidi virali. [ANCORA...]
	Kinesina Apr. 2005 Poiché le cellule sono molto piccole, la maggior parte dei processi cellulari usa la semplice diffusione casuale per trasportare materiali da un luogo all'altro. Per esempio, quando una molecola di glucosio viene degradata nella glicolisi, i dieci enzimi e tutti i frammenti intermedi vengono riversati insieme nel citoplasma dove vagano casualmente fino a quando ogni molecola non trova la sua giusta destinazione. Per le molecole e le proteine di piccole dimensioni, la diffusione casuale è abbastanza veloce e funziona bene, ma per le molecole più grandi, le cellule devono adottare una strategia più attiva. Qui entrano in campo i motori molecolari. Le cellule costruiscono una varietà di motori che trascinano le molecole più grandi alla loro giusta destinazione. [ANCORA...]
	Autosplicing RNA Mag. 2005 La Natura è piena di sorprese, così accade spesso che quando si crede di aver capito qualcosa, in Natura si trova un'eccezione. Vent'anni fa questo è successo con gli enzimi. I biochimici pensavano, dopo decadi di lavoro, che le proteine fossero le uniche molecole capaci di catalizzare le reazioni chimiche nella cellula. Quindi è stata una sorpresa quando Thomas Cech ed i suoi collaboratori hanno scoperto una reazione spontanea di splicing dell'RNA che avveniva anche quando tutte le proteine erano state rimosse. Da allora i ricercatori hanno scoperto molti altri esempi di ribozimi, molecole di RNA in grado di catalizzare le reazioni chimiche. [ANCORA...]
	Carotenoidi ossigenasi Giu. 2005 Mangia le carote o diventerai cieco! La ragione biochimica di questa minaccia che viene ogni tanto rivolta ai bambini è che abbiamo bisogno di retinale, la vitamina A, per formare il pigmento fotosensibile dei nostri occhi. Sfortunatamente, le nostre cellule non sono in grado di costruirlo da sole, così dobbiamo assumerlo con la dieta. Possiamo ottenere la nostra dose giornaliera di vitamina A in due modi diversi. Possiamo mangiare cibi che contengono retinale, come per esempio la carne, oppure possiamo mangiare cibi che contengono molecole che possono essere trasformate in retinale e qui entrano in gioco le carote. Queste sono ricche di beta-carotene che le nostre cellule possono tagliare a metà per formare due molecole di retinale usando l'enzima carotenoidi ossigenasi. [ANCORA...]
	Proteina TATA-legante Lug. 2005 L'enzima RNA polimerasi ha il compito delicato di svolgere i due filamenti di DNA e di usarne uno come stampo per trascrivere le informazioni genetiche su un nuovo filamento di RNA. Ma come fa a sapere da quale punto del DNA cominciare? Le nostre cellule contengono oltre 30.000 geni che sono formati da miliardi di nucleotidi. Per ogni gene, la cellula deve essere in grado di avviare la trascrizione nel punto giusto e al momento giusto. [ANCORA...]
	Neurotrofine Ago. 2005 Il nostro cervello è formato da 85 miliardi di neuroni interconnessi. Ogni neurone riceve segnali dai neuroni vicini e quindi decide se inviare o no il proprio segnale ad altre cellule nervose. L'azione combinata di tutti questi neuroni ci permette di sentire il mondo circostante, di elaborare ciò che sentiamo e di agire di conseguenza. [ANCORA...]
	Tossina del Colera Set. 2005 I batteri non tirano pugni quando lottano per difendersi. Alcuni batteri, come ad esempio il vibrione del colera, sintetizzano delle tossine così potenti che una singola molecola può uccidere una cellula intera. Una simile tossina è molto più efficace dei più potenti veleni chimici come il cianuro o l'arsenico. I veleni chimici attaccano molecole importanti per la vita e vi si legano strettamente, quindi sono necessarie moltissime molecole di cianuro per uccidere una cellula. Le tossine batteriche invece usano due diverse strategie per trasformarsi in agenti molto più mortali di così. [ANCORA...]
	Proteine Artificiali Ott. 2005 Dato che impariamo sempre di più sulle proteine e sul loro funzionamento, è naturale che vogliamo usare queste conoscenze per modificare proteine o per costruirne di nuove. Fin dai primi anni 1980, gli scienziati hanno usato le nuove conoscenze sulla struttura e sulla funzione delle proteine per ridisegnare proteine esistenti e, più recentemente, per progettare proteine completamente nuove. [ANCORA...]
	Recettore dell'acetilcolina Nov. 2005 Le cellule nervose devono essere in grado di mandarsi messaggi in modo rapido e chiaro. Uno dei modi in cui le cellule nervose comunicano con le loro vicine consiste nel mandare un getto di piccole molecole di neurotransmettitore. Queste molecole diffondono verso la cellula vicina e si legano a speciali proteine, i recettori, sulla superfice cellulare. Questi recettori si aprono e permettono agli ioni sodio di entrare. [ANCORA...]
	ATP Sintasi Dic. 2005 L'ATP sintasi è una delle meraviglie del mondo molecolare. L'ATP sintasi è un enzima, un motore molecolare, una pompa ionica, ed un altro motore molecolare tutti legati insieme in una macchina incredibile dalle dimensioni nanometriche. Ha un ruolo indispensabile nelle nostre cellule dato che sintetizza la maggior parte dell'ATP che dà energia ai processi cellulari. Il meccanismo col quale agisce è davvero sorprendente. [ANCORA...]