Molecola del Mese di David S. Goodsell Trad. di Mauro Tonellato

ATP Sintasi

Indice 2005

Esplorando la Struttura di F0
Il file PDB 1c17 include il motore protonico F0. In questa figura, la vista è lungo l'asse di rotazione, come se si guardasse verso il basso dalla cima della figura in prima pagina. Il rotore è composto di 12 catene proteiche identiche, colorate qui in blu e azzurro, e la pompa ionica è una singola catena colorata in rosa. La pompa ha un amminoacido di arginina (rosso) che cede uno ione idrogeno agli aspartati sul rotore. Gli amminoacidi di aspartato hanno una carica negativa, ma poichè il rotore è immerso nei lipidi della membrana interna dei mitocondri, questa carica negativa è molto sfavorevole. Quindi, il rotore gira per permettere agli aspartati di legarsi agli ioni idrogeno diventando acidi aspartici neutri. Gli ioni idrogeno quindi seguono un percorso contorto attraverso il motore F0 e fanno girare il rotore al loro passaggio. Vengono presi dallo spazio intermembrana del mitocondrio da una catena di amminoacidi della pompa, e trasferiti all'arginina. L'arginina passa gli ioni idrogeno al rotore il quale così gira. Poi l'idrogeno viene ceduto ad altri amminoacidi della pompa, e trasferito finalmente nella parte più interna del mitocondrio. Il percorso esatto degli ioni idrogeno attraverso la pompa non è però ancora del tutto chiarito.

Queste figure sono state create con RasMol (Chime). Anche voi potete realizzare immagini simili cliccando sui codici di accesso qui sopra e scegliendo una delle opzioni nel menù View Structure.

Un elenco di tutti i file relativi all'enzima ATP sintasi presenti nel PDB fino al 1 dicembre 2005 è disponibile qui.
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