Molecola del Mese di David S. Goodsell Trad. di Mauro Tonellato

ATP Sintasi

Indice 2005

Esplorando la Struttura di F1
Il file PDB 1e79 contiene il motore F1 dell'ATP sintasi. Quando opera come generatore, usa l'energia del moto di rotazione per costruire ATP. Quando opera come motore, rompe ATP per ruotare l'asse nella direzione opposta. I due passi difficili nella sintesi di ATP sono il fissaggio di ADP e la liberazione di ATP. La formazione del legame fosfato-fosfato non è il problema più difficile. Quando l'asse ruota, costringe il motore ad assumere tre conformazioni diverse che aiutano a realizzare questi passaggi. Due stati sono mostrati qui. Quello sulla sinistra mostra una conformazione che aiuta il legame con ADP, quello sulla destra mostra una conformazione che è stata costretta ad aprirsi per rilasciare ATP. Notate come l'asse, con la sua forma particolare, favorisce il cambio di conformazione.

Potete osservare voi stessi questa struttura cliccando sul codice di accesso PDB 1e79. Decomprimete il file pdb compresso a lanciatelo. Si aprirà una schermata in Internet Explorer con struttura tridimensionale della proteina (se avete installato CHIME) nella quale potrete scegliere una delle opzioni nel menù View Structure. L'asse centrale è composto dalle catene G, H, I. Tre delle subunità, le catene D, E, F, sono le parti che generano ATP. La subunità D è mostrata in rosa nella figura a sinistra mentre lega al centro una molecola di ADP, la subunità E è mostrata in rosa nella figura a destra. Le subunità A, B, C sono simili ed hanno un ruolo strutturale, tengono ogni parte al suo posto. In queste figure sono state rimosse le due subunità più vicine all'osservatore per rendere visibile la struttura interna del complesso.

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