Molecola del Mese di David S. Goodsell Trad. di Mauro Tonellato

Caspasi

Indice 2004

Esplorando la Struttura
Come potete immaginare, le caspasi sono enzimi pericolosi per le cellule, così vengono creati sotto forma di proenzimi inattivi. La struttura qui sopra sulla sinistra, dall'archivio PDB 1k88, ce ne mostra un esempio, la procaspasi-7. Il sito attivo contiene una cisteina reattiva, mostrata in giallo e due amminoacidi basici (due arginine) mostrati in blu che riconoscono l'aspartato nella proteina che viene tagliata. Come potete vedere, la procaspasi è flessibile e questi tre amminoacidi chiave non sono riuniti in un sito attivo compatto. Quando la caspasi è attivata, dopo che ha subito alcuni tagli strategici nella catena proteica, il sito attivo può assumere la conformazione corretta. La struttura sulla destra, dall'archivio PDB 1f1j, mostra la forma attiva della caspasi-7 con una piccola catena proteica legata nel sito attivo. La struttura coglie l'enzima nel mezzo della sua reazione. La cisteina è legata alla catena proteica bersaglio, e l'aspartato è infilato in mezzo ai due aminoacidi basici.

Questa figura è stata creata con RasMol (Chime). Anche voi potete creare immagini simili cliccando sui codici di accesso qui sopra e scegliendo una delle opzioni nel menù View Structure.

Un elenco di tutte le strutture di Caspasi presenti negli archivi PDB fino all'agosto 2004 è disponibile qui.
Per ulteriori informazioni sulle caspasi, cliccate qui.

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