Esplorando la Struttura
Queste due straordinarie strutture cristallografiche mostrano una immagine iniziale e una finale dell'azione della alfa-1-antitripsina. Sulla sinistra, il file PDB 1k9o, mostra il complesso serpina-proteasi prima che scatti la trappola. Gli scienziati hanno usato una forma mutante della proteasi, con la serina reattiva sostituita da una alanina (mostrata in giallo), per poter osservare il complesso senza fare scattare la trappola. Notate le quattro lunghe catene parallele nella serpina, colorate di bianco. Sulla destra, l'archivio PDB 1ezx, mostra il complesso dopo che è scattata la trappola: il filamento è stato tagliato, e la tripsina è stata trascinata giù fino all'altro lato della serpina. La serina reattiva della tripsina (in giallo) è unita con un legame covalente alla metionina della serpina (in rosso). Notate come la catena del filamento tagliato è scattata portandosi in mezzo alle quattro catene parallele. Notate anche che la tripsina si è deformata. Gran parte della catena proteica non è visibile nella struttura cristallina perché si stava muovendo troppo. Le piccole stelle mostrano i punti dove la struttura sperimentale finisce e i filamenti non sono visibili.

Questa figura è stata creata usando RasMol. Anche voi potete realizzare immagini simili cliccando sui codici di accesso PDB e scegliendo una delle opzioni nel menù View Structure.

Un elenco di tutte le strutture riferite alle Serpine presenti nel PDB fino all'aprile 2004 è disponibile qui.
Per ulteriori informazioni sulle serpine, cliccate qui.

Molecola del Mese - Indice completo

PianetaChimica home