Far Scattare la Trappola
Il filamento flessibile delle serpine, noto come il filamento del centro reattivo, è l'esca e il braccio a molla della trappola. La proteasi, mostrata qui in verde, si lega all'esca (rosa) e comincia a compiere la sua normale reazione di taglio della catena proteica. La struttura sulla sinistra, dall'archivio PDB 1k9o, mostra la tripsina (verde) subito dopo che si è legata. La serina reattiva della proteasi attacca il filamento, forma un legame con la catena, e realizza il taglio. Normalmente a questo punto dovrebbe intervenire una molecola di acqua, per liberare la proteasi dalla sua molecola bersaglio. Ma invece la serpina (blu) prende il controllo prima che la sfortunata tripsina possa liberarsi. Il filamento flessibile, appena tagliato, è libero di muoversi e scatta portandosi all'interno di una vasta fenditura sul lato della serpina, trascinando con sè la proteasi (verde) dall'altro lato della serpina, come mostrato nella struttura qui sopra a destra, dall'archivio PDB 1ezx. Si potrebbe pensare che la tripsina potesse ancora compiere il resto della sua reazione e liberarsi. Ma il filamento della serpina, bloccato fermamente nella fenditura, è troppo corto, così la tripsina resta bloccata e in tensione contro il fondo della serpina. Questo deforma il sito attivo della tripsina, tanto da renderlo inattivo. La tripsina è deformata e in parte perde il suo corretto ripiegamento. Questo la trasforma in un facile bersaglio per l'apparato cellulare che spazza via le proteine difettose che così distrugge sia la proteasi che la serpina, un enzima che quindi può agire una sola volta.

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