Molecola del Mese di David S. Goodsell Trad. di Mauro Tonellato

RNA Polimerasi

Indice 2003

Avvelenare la Polimerasi
Poichè la RNA polimerasi è assolutamente essenziale per la vita della cellula, è un obiettivo ideale per veleni e tossine. Il più potente di questi veleni è la alfa-amanitina, un piccolo peptide circolare prodotto dal fungo Amanita Falloide. Mangiare anche uno solo di questi funghi conduce prima al coma e poi alla morte nel giro di pochi giorni, perchè il veleno attacca la RNA polimerasi in tutto il corpo. Sorprendentemente, la tossina si lega sul lato posteriore della RNA polimerasi, lontano dal sito attivo e lontano dal sito di legame per il DNA e per l'RNA. Non blocca fisicamente il sito attivo, come la maggior parte degli inibitori, ma paralizza il meccanismo d'azione dell'enzima. La RNA polimerasi è un enzima estremamente mobile che si piega e cambia forma mentre svolge le varie fasi della sua azione: legare il DNA, svolgerlo, e quindi costruire il nuovo filamento di RNA. Come si può vedere nella figura qui sopra, dall'archivio PDB 1k83, il veleno si lega tra due subunità della proteina, incollandole insieme e bloccando questi movimenti essenziali.

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