Molecola del Mese di David S. Goodsell Trad. di Mauro Tonellato

RNA Polimerasi

Indice 2003

Non Solo Messaggero
L'RNA è una molecola versatile. Nel suo ruolo più conosciuto, l'RNA si comporta come un intermediario, trasportando informazioni genetiche dal DNA all'apparato di sintesi delle proteine, ed è conosciuto come RNA messaggero o mRNA. L'RNA ha anche ruoli più attivi, svolgendo molte delle funzioni catalitiche e di riconoscimento normalmente riservate alle proteine. La maggior parte dell' RNA nelle cellule si trova nei ribosomi (le nostre macchine per sintetizzare le proteine) ed è chiamato RNA ribosomiale o rRNA. Un'altra forma importante di RNA è il transfer RNA, tRNA, che serve ad aggiungere nuovi amminoacidi alle catene proteiche in crescita. Esistono Inoltre innumerevoli piccole molecole di RNA coinvolte nel regolare, trasformare e distribuire il continuo flusso di molecole di RNA messaggero. L'enzima RNA polimerasi ha la grande responsabilità di sintetizzare tutte queste molecole di RNA diversi.

La Fabbrica dell'RNA
La RNA polimerasi è una fabbrica enorme con molte parti mobili. Quella mostrata qui a destra, dall'archivio PDB 1i6h, proviene da cellule di lievito. È composta di una dozzina di proteine diverse che, insieme, formano una macchina che circonda i due filamenti del DNA, li svolge, e costruisce un nuovo filamento di RNA basato sulle informazioni contenute in uno dei due filamenti di DNA. Una volta che l'enzima ha cominciato la sua opera, la RNA polimerasi procede con sicurezza lungo il DNA copiando filamenti di RNA lunghi migliaia di nucleotidi.

Accuratezza
Come potete immaginare, la RNA polimerasi deve essere molto accurata nel copiare le informazioni genetiche. Per migliorare la sua accuratezza, compie una semplice operazione di correzione mentre sintetizza un filamento di RNA. Il sito attivo ha una struttura che è in grado anche di rimuovere nucleotidi oltre che di aggiungerli al filamento in crescita. L'enzima tende a rimanere più a lungo sopra i nucleotidi errati rispetto a quelli aggiunti correttamente, in questo modo l'enzima ha il tempo di rimuoverli. Questo processo è piuttosto dispendioso, poichè talvolta vengono rimossi anche nucleotidi corretti, ma vale la pena di fare questo piccolo sacrificio per sintetizzare dei migliori trascritti di RNA. Nel complesso, la RNA polimerasi fa circa un errore ogni 10.000 nucleotidi aggiunti, o circa un errore per ogni filamento di RNA sintetizzato.

Seguente: Avvelenare la Polimerasi