Molecola del Mese di David S. Goodsell Trad. di Mauro Tonellato

Soppressore di Tumore p53

Indice 2002

Abbracciare il DNA
Il soppressore di tumore p53 si lega al DNA usando tutte e quattro le sue braccia. Il tipico sito di legame sul DNA è composto di tre parti: uno specifico sito di legame per due domini del p53, un tratto di catena di lunghezza variabile da 0 a 13 paia di basi, ed un secondo sito specifico di legame per gli altri due domini del p53. Nelle figura mostrata qui a sinistra (costruita usando tre diverse strutture prese dagli archivi PDB 1tup, 1olg e 1ycq), due domini del p53 sono legati vicino alla parte superiore del filamento di DNA e due sono legati ad un sito identico vicino al fondo. Il dominio di tetramerizzazione è dietro all'elica e tiene insieme tutte e quattro le catene. I quattro domini di transattivazione si estendono lungo l'elica di DNA, pronti ad attivare proteine vicine coinvolte nel leggere il DNA. Le catene flessibili, che collegano insieme tutte e quattro le braccia, permettono al p53 di legarsi a molte varianti diverse di questo sito di legame, permettendogli di regolare la trascrizione in molti punti nel genoma.

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