Molecola del Mese
di David S. Goodsell
Trad. di Mauro Tonellato
Trombina

Nel Posto Giusto al Momento Giusto
Chiaramente la coagulazione del sangue deve essere attentamente regolata, altrimenti il sangue potrebbe coagulare nei posti sbagliati. Ogni errore nella coagulazione del sangue può avere effetti disastrosi: grumi di sangue nel cuore provocano l'infarto e grumi di sangue che giungono al cervello provocano l'ictus.
La trombina viene controllata in due modi. Per prima cosa, viene sintetizzata come protrombina cioè come forma inattiva che diventerà trombina attiva solo al momento opportuno. La protrombina ha una struttura complessa ed è composta di più subunità come si può vedere qui a fianco in basso (archivio PDB 1a0h sulla sinistra e 2pf2 sulla destra, i puntini indicano un terzo frammento mancante). La protrombina possiede quindi delle catene proteiche in più, colorate qui in azzurro, che vengono eliminate quando la proteina deve essere attivata. Gli atomi color magenta in basso a destra sono ioni calcio, sono legati ad amminoacidi glutammato modificati. La forte carica positiva di questi ioni blocca la proteina sulla superficie dei vasi sanguigni, così la protrombina non può muoversi. La trombina attiva viene quindi formata solo nelle immediate vicinanze del punto danneggiato e così i coaguli di sangue non possono formarsi altrove. In secondo luogo, la trombina attivata, che ha la struttura mostrata qui a fianco in alto (dall'archivio PDB 1ppb), ha una vita molto breve, non più di qualche secondo, limitando anche in questo modo la formazione del coagulo alla sola area danneggiata.

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