Molecola del Mese
di David S. Goodsell
Trad. di Mauro Tonellato
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Molecola del Mese di David S. Goodsell Trad. di Mauro Tonellato |
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Un Enzima Complesso
Questo enzima, in realtà, ha due siti attivi diversi, chiamati complessivamente
prostaglandina sintasi. Su un lato, c'è il sito attivo di cicloossigenasi
discusso nella pagina precedente. Sul lato opposto, c'è il sito di perossidasi
completamente separato dall'altro, che è necessario per attivare i gruppi
eme che partecipano alla reazione di cicloossigenasi. Il complesso enzimatico
in realtà è un dimero composto di due subunità identiche,
così ci sono due siti attivi di cicloossigenasi e due siti attivi di
perossidasi molto vicini gli uni agli altri. Inoltre, ogni subunità ha
una piccola protuberanza ricca di catene idrocarburiche apolari, diretta verso
il basso in questa figura. Queste protuberanze ancorano il complesso alla membrana
del reticolo endoplasmatico, mostrata in azzurro sul fondo della figura. Il
sito attivo di cicloossigenasi è nascosto in profondità all'interno
della proteina, ed è raggiungibile attraverso un tunnel che sbuca al
centro della protuberanza. Il tunnel si comporta come un imbuto, guidando l'acido
arachidonico fuori dalla membrana e all'interno dell'enzima dove viene fatto
reagire. Nella struttura mostrata qui (dall'archivio PDB 4cox),
un farmaco (giallo e verde) sta bloccando il sito attivo in entrambe le subunità.
In ogni subunità sono anche visibili i gruppi eme sopra le molecole del
farmaco.
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