Molecola del Mese di David S. Goodsell Trad. di Mauro Tonellato

RNA Transfer

Indice 2001

Esplorando la Struttura
Naturalmente, la prima cosa che esaminiamo nella struttura del tRNA è l'anticodone. Nella figura in alto a sinistra si può vedere un aspartato tRNA (dall'archivio PDB 2tra). Quando è stato fatto cristallizzare per sottoporlo all'analisi ai raggi x, questo tRNA ha formato un dimero nel quale gli anticodoni delle due molecole si sono legati insieme. Il segmento dalla seconda molecola, mostrato nella parte bassa della figura (con i carboni colorati in verde), ci può dare un'idea di come il codone dell'RNA messaggero si legherebbe all'anticodone del tRNA. L'anticodone in questa struttura è composto da guanina 34, uracile 35, e citosina 36.
La figura qui sopra sulla destra mostra il fenilalanina tRNA (dall'archivio PDB 4tna) nel quale si può osservare una strana interazione che coinvolge tre basi. La citosina e la guanina formano un normale paio di basi, proprio come nel DNA, ma una seconda guanina, modificata con un gruppo metilico (sfera bianca), forma un'insolita interazione legandosi lateralmente al paio di basi.

Queste figure sono state realizzate con RasMol (Chime). Anche voi potete creare immagini simili cliccando sui codici di accesso PDB, e scegliendo una delle opzioni nel menù "View Structure".

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