![]() Molecola del Mese di David S. Goodsell Trad. di Mauro Tonellato |
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Esplorando la Struttura
L'insulina è una molecola perfetta per esplorare
la struttura delle proteine. È abbastanza piccola che possiamo rappresentarne
tutti gli atomi ed avere ancora un'immagine non confusa. L'insulina umana illustrata
qui sopra (dall'archivio PDB 1trz) contiene quattro catene,
identificate dalle lettere A, B, C, e D. Se esaminamo con CHIME direttamente
il file originale cliccando sul codice PDB 1trz, possiamo
visualizzare solo le catene A e B che insieme costituiscono un singolo monomero
di insulina.
(Select - Chain - C e poi Select - Hide - Hide Selected
E ancora:
Select - Chain - D e poi Select - Hide - Hide Selected).
In questa struttura si possono vedere molte delle caratteristiche chiave che
stabilizzano la struttura di una proteina. Si noti il gruppo di amminoacidi
apolari, come leucina ed isoleucina che si raggruppano nel cuore dell'insulina
formando un centro idrofobico. Si noti che la superficie della proteina è
invece coperta di amminoacidi carichi come lisina, arginina e glutammato. Questi
amminoacidi interagiscono favorevolmente con l'acqua circostante. Si notino
infine i tre ponti disolfuro tra amminoacidi di cisteina che stabilizzano questa
piccola proteina.
Questa figura è stata creata con RasMol (Chime). Anche voi potete creare
immagini simili cliccando sui codici di accesso qui sopra e scegliendo una delle
opzioni nel menù "View Structure".
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con l'Insulina