Molecola del Mese di David S. Goodsell Trad. di Mauro Tonellato	Lisozima	Indice 2000

Esplorando la Struttura

Il lisozima ha un sito attivo a forma di lunga fenditura che si lega alle catene di carboidrati della parete cellulare dei batteri. La struttura mostrata qui contiene un frammento di parete cellulare batterica, con due zuccheri con struttura ciclica e un piccolo pezzo di peptide dei legami trasversali. Basandosi sui modelli molecolari al computer, è stato proposto che il lisozima distorga la forma di uno degli anelli di zucchero della catena, rendendolo più facile da rompere (altri studi hanno suggerito che effetti diversi, come quelli elettrostatici, siano più importanti). Questa struttura, dall'archivio PDB 148l, mostra la possibile struttura di questo anello distorto. Normalmente, gli anelli degli zuccheri adottano una forma a "sedia" a zig-zag, come l'anello viola sulla destra. Confrontate questo anello con quello sulla sinistra, verde, che ha una forma appiattita, meno stabile.

Queste figure sono state create con RasMol. Anche voi potete creare immagini simili cliccando sui codici di accesso PDB qui sopra, e poi scegliendo una voce nel menù "View Structure".