Molecola del Mese di David S. Goodsell Trad. di Mauro Tonellato	Lisozima	Indice 2000

Laboratorio Molecolare

Il lisozima è un enzima piccolo e stabile che costituisce un modello ideale per la ricerca sulla struttura e la funzione delle proteine.
Brian Matthews, all'Università dell'Oregon, ha compiuto una serie straordinaria di esperimenti e ha usato il lisozima come laboratorio di ricerca. Egli ha realizzato centinaia di mutazioni sulla molecola di lisozima utilizzando la tecnica del batteriofago, sostituendo uno o più amminoacidi nella catena proteica con altri diversi. Ha studiato l'effetto di rimuovere amminoacidi ingombranti dall'interno della proteina lasciando un buco, o quello di introdurre all'interno della proteina un grosso amminoacido dove normalmente non ci sarebbe stato. Ha cercato di creare nuovi siti attivi creando nuove tasche dalla forma di molecola.

Negli archivi PDB sono disponibili le strutture di centinaia di questi lisozimi mutanti, in realtà queste strutture sono così numerose che il lisozima rappresenta la proteina più comune negli archivi PDB. L'esempio mostrato qui sopra rappresenta un mutante nel quale due amminoacidi (mostrati in verde) sono stati sostituiti con cisteina, formando un nuovo ponte disolfuro (i due atomi gialli) nel mutante. L'enzima nativo, dall'archivio PDB 1lyd, è sulla sinistra, mentre il mutante, dall'archivio PDB 1l35, è sulla destra.