Molecola del Mese
di David S. Goodsell
Trad. di Mauro Tonellato
|
Molecola del Mese di David S. Goodsell Trad. di Mauro Tonellato |
|
Esplorando la Struttura
La tripla elica del collagene è resa compatta e stabile da una particolare sequenza di amminoacidi. Un amminoacido ogni tre è glicina e molti dei rimanenti amminoacidi sono prolina o idrossiprolina. Qui a fianco è mostrata una tipica tripla elica ottenuta dall'archivio PDB 1cag. Notate come la glicina formi un gomito sottile all'interno dell'elica, e notate che la prolina e l'idrossiprolina piegano dolcemente la catena proteica a forma di elica. In questa struttura i ricercatori hanno messo un amminoacido più grande, alanina, nella posizione normalmente occupata dalla glicina, per dimostrare che questa crea problemi di ingombro sterico con le catene vicine.
La catena di collagene qui a fianco, contiene un segmento di collagene umano, ed è disponibile all'archivio PDB 1bkv. Notate che la parte superiore è molto uniforme, dove la sequenza è quella ideale composta di glicina, prolina, idrossiprolina. Nella parte inferiore l'elica è meno regolare perchè sono stati introdotti amminoacidi diversi tra le glicine spaziate regolarmente.
Avanti: Corde
e scale
|
