|
Pianeta
Chimica.it
Responsabile:
Prof. Mauro Tonellato
|
|
MODELLISTICA MOLECOLARE
CON ArgusLab
12^ LEZIONE
Cicloaddizioni di Diels-Alder
|
| |
|
|
|
Lezioni con ArgusLab:
1^
1-butene e 2-butene
2^
Carbocatione 1° e 2°
3^
Acetone e tautomeria
4^
Dieni coniugati pdf
5^
Benzene e aromaticità pdf
6^ Legame covalente
7^ Conformazione alcani
8^ Struttura delle proteine
9^ Legandi e Siti di legame
10^ Docking Molecolare
11^ Ponte Cloronio
12^ Diels-Alder
Chimica
al Computer
PianetaChimica home
|
|
Per seguire questa lezione dovete avere già visto la 1^ e la 2^
lezione di modellistica molecolare con ArgusLab nelle quali sono state
spiegate le procedure di base che qui verranno date per conosciute.
Questa lezione può essere svolta in due modi
1) Online. Potete leggere le istruzioni, eseguire l'esercizio con
ArgusLab, usare le illustrazioni per vedere quel che dovreste ottenere.
2) In aula informatica con la classe. Se siete insegnanti di chimica,
potete adattare la lezione alle esigenze della vostra classe e poi riproporla
in aula informatica ai vostri allievi. La durata della lezione è
di circa due ore.
N.B. Cliccando sulle immagini potrete vederle a pieno schermo!

Gli argomenti di questa lezione sono:
-- Cicloaddizione di Diels Alder
-- Costruzione di 1,3 butadiene e di etilene
-- Discussione sulla simmetria degli orbitali coinvolti nella reazione
-- Confronto con altre cicloaddizioni proibite
|
|
Cicloaddizione di Diels-Alder
Un diene coniugato come 1,3-butadiene può reagire con un alchene
per dare cicloesene in una reazione di addizione periciclica concertata
conosciuta come cicloaddizione di Diels-Alder.
La cicloaddizione di due semplici alcheni per produrre ciclobutano, invece,
non può avvenire.
La teoria VB non riesce a spiegare questa differenza di reattività
infatti il meccanismo di reazione che invoca per spiegare la cicloaddizione
di Diels-Alder si può applicare anche alla cocloaddizione di due
alcheni anche se questa non è possibile.
Per spiegare perchè la cicloaddizione [4+2] del butadiene con l'etilene
può avvenire, mentre la cicloaddizione [2+2] tra due molecole di
etilene non avviene, bisogna ricorrere alla teoria MO degli orbitali molecolari.
La teoria MO dice che quando due molecole reagiscono, le interazioni tra
gli orbitali pieni di una e dell'altra portano ad un vistoso aumento
dell'energia complessiva delle due molecole che così si avviano
a formare lo stato di transizione. Per dare luogo ai prodotti di reazione
servono delle interazioni favorevoli che facciano diminuire l'energia
del sistema, queste sono interazioni tra cariche positive e negative
nelle due molecole e inoltre tra l'orbitale HOMO di una molecola
e l'orbitale LUMO dell'altra.
Cioè l'orbitale pieno di più alta energia (HOMO)
di una molecola deve mettere in comune i propri elettroni con l'orbitale
vuoto di minore energia (LUMO) dell'altra.
Gli orbitali HOMO e LUMO vengono anche chiamati orbitali frontiera
perchè segnano il confine tra orbitali di legame e di antilegame
L'interazione HOMO-LUMO è favorevole perchè deve
sistemare solo due elettroni che quindi vanno nell'orbitale di legame.
Si forma così uno stato di minore energia come si vede nella seguente
figura.
L' interazione tra orbitali pieni, invece, deve sistemare quattro
elettroni, quindi ne porta due nell'orbitale di legame e due in quello
di antilegame con un effetto complessivo sfavorevole come accade nella
ipotetica molecola He2.
L'interazione HOMO-LUMO, d'altra parte non è sempre favorevole,
ma come qualsiasi altra coppia di orbitali, quando viene sovrapposta può
dare interazione di legame o di antilegame. Se i lobi sono dello stesso
segno si ottiene un legame, mentre quando sono di segno opposto
si ottiene un antilegame.
Gli orbitali molecolari p del butadiene
sono quattro, due di legame e due di antilegame e sono rappresentati qui
di seguito. I colori bianco e grigio sugli orbitali p
indicano i lobi positivi e negativi della funzione d'onda.
|
|
|
|
|




orbitali p
del butadiene
fig. 1
|
|
|
orbitali
p del butadiene
Quando i lobi degli orbitali p adiacenti
nella molecola del butadiene sono dello stesso segno producono un legame.
Questo legame, però non è stato disegnato in modo esplicito
nella figura qui sopra in bianco e nero, ma è stato sottointeso e
bisogna immaginarlo come nelle corrispondenti figure a colori qui a lato
ottenute con ArgusLab (fig. 1).
Gli orbitali molecolari p dell'etilene
sono due, uno di legame e uno di antilegame.
orbitali
p dell'etilene
Quando 1,3-butadiene ed etilene reagiscono per dare una cicloaddizione
di Diels-Alder, hanno interazioni favorevoli tra gli orbitali HOMO e
LUMO e questo spiega perchè la reazione procede formando cicloesene.
Gli orbitali HOMO e LUMO, infatti, si sovrappongono avvicinando lobi dello
stesso segno, come si vede nella figura qui sotto.

Quando reagiscono tra loro due molecole di etilene, invece, l'interazione
HOMO-LUMO non è favorevole come si vede nella seguente figura. La
sovrapposizione è favorevole su un orbitale, ma sfavorevole sull'altro
dove si avvicinano lobi di segno opposto.

In questo modo la teoria MO riesce a spiegare perchè la cicloaddizoine
di 1,3-butadiene ed etilene è possibile e produce cicloesene, mentre
la cicloaddizione di due molecole di etilene non ha luogo e non riesce a
produrre ciclobutano.
|
|
|
|
Creare 1,3-butadiene
Per iniziare questa esercitazione, costruite con
ArguLab la molecola 1,3-butadiene.
Create la catena unendo in sequenza quattro carboni sp2:
C(trigonal planar) - Shift+Click destro.
Controllate che tutti 4 i carboni abbiano una struttura sp2
planare. (Click destro - Change Atom)
Aggiungete gli idrogeni (pulsante H).
Evidenziate i doppi legami: Click destro sul legame - Double
Otterrete così la struttura grezza del 1,3-butadiene mostrata
in figura 2.
Salvate la molecola col nome butadiene.
Ottimizzatela col metodo UFF e poi col metodo PM3 (Calculation - Optimize
Geometry - PM3 - Start) (figura 3).
Calcolate l'energia della molecola (Calculation
- Energy - PM3 - Start).
Otterrete un'entalpia di formazione di circa 31.041 kcal/mol.
Il butadiene che avete ottenuto è in conformazione sigma-trans
(figura 3). Per ottenere la forma sigma-cis, necessaria per
la reazione di cicloaddizione, procedete così:
Cliccate il legame centrale e premendo Alt+Shift
cliccate e trascinate il mouse fino ad ottenere un angolo di sirca 180°
(figura 4).
Ottimizzate il butadiene sigma-cis col metodo
PM3
Salvate la molecola col nome butadiene_PM3_cis.
Calcolate l'energia della molecola.
Otterrete un'entalpia di formazione di circa 31.772 kcal/mol
La forma sigma-trans è quindi più stabile di circa 0,731
kcal/mol rispetto alla forma sigma-cis.
Dall'equazione DG°
= - RT lnk potete stimare il valore della k di equilibrio della reazione
di interconversione tra le due conformazioni del butadiene
sigma-cis => sigma-trans .
. . . . . DH°
= - 0,731 kcal/mol
lnk = - DG°
/ RT
lnk = 0,731 4184 / 8,31 298
lnk = 1,235
k = 3,44
Quindi solo circa il 22,5% del butadiene si trova nella forma sigma-cis
a 25 °C. Questo ci fa capire perchè la cicloaddizione di Diels-Alder
è più veloce se si fa reagire ciclopentadiene al posto di
1,3-butadiene: il diene ciclico ciclopentadiene
si trova al 100% nella forma sigma-cis.
|

fig. 5

fig. 6
|
|
Creare i quattro orbitali molecolari pigreco del butadiene
Create i quattro orbitali p
del butadiene : Calculation - Energy - Surface Properties - 9, 11 homo,
12 lumo, 13 - OK - Start.
Rappresentate i quattro orbitali p
sullo schermo : Surfaces - Make Surfaces - RHF MOs. Trascinate l'orbitale
9 nella finestra Grid, scrivete 9 nella finestra Surface Name, cliccate
Create>>.
Ripetete l'operazione per gli altri orbitali: 11 homo, 12 lumo, 13.
Il simbolo degli orbitali creati compare nella finestrella a destra (fig.
5) scegliete un orbitale e accendetelo con Toggle Display.
L'orbitale scelto verrà mostrato da ArgusLab nella finestra di
lavoro.
Osservate i vari orbitali e notate che il primo, 9, non ha nodi verticali
(oltre a quello orizzontale p),
mentre gli altri ne hanno rispettivamente 1, 2 e 3.
L'orbitale 11 homo può anche avere i lobi colorati in modo
opposto rispetto a quello mostrato in fig. 1 come si vede qui a lato in
figura 6.
|

fig. 7
fig. 8
|
|
Creare etilene
Create la catena di 2 carboni dell'etilene: C(trigonal planar) - Shift+Click
destro.
Controllate che i 2 carboni abbiano una struttura sp2
planare. (Click destro - Change Atom)
Aggiungete gli idrogeni (pulsante H).
Evidenziate il doppio legame: Click destro sul legame - Double
Salvate la molecola col nome etilene.
Ottimizzatela col metodo PM3 (Calculation - Optimize Geometry - PM3 -
Start) (figura 7).
Salvatela col nome etilene_PM3.
Creare i 2 orbitali pigreco dell'etilene
Utilizzate la stessa procedura seguita per il butadiene per creare i due
orbitali molecolari 6 homo e 7 lumo dell'etilene.
Nella figura 8 è illustrato l'orbitale 7 lumo
|
fig. 9

fig 10
|
|
Mettere l'etilene
vicino al butadiene
Cliccate sul pulsante Show the Molecule Tree View
.
Nella finestra di sinistra (ad albero) seguite il percorso etilene -
Residues - Misc e cliccate su 1 Def , la molecola di etilene
è così selezionata e appare gialla.
Scegliete Edit - Copy per copiarla in memoria.
Nella finestra ad albero cliccate su butadiene.
Cliccate in un punto dello schermo a fianco del butadiene e premete Ctrl
+ V per mettere in quel punto l'etilene. L'etilene giallo compare nello
schermo come in figura 9 all'interno di una sfera blu chiamata Manipolatore.
Nella finestra ad albero compare 2 Def (etilene) accanto a 1 Def
(butadiene) nel percorso: butadiene - Residues - Misc
Posizionate il cursore sopra l'etilene nel manipolatore e potrete ruotarlo
cliccando e trascinando il mouse.
Per spostare l'etilene cliccate e trascinate il mouse con Ctrl premuto.
Posizionate l'etilene proprio sotto il butadiene come in figura 10.
Per cambiare punto di vista, ruotate tutte e due le molecole insieme cliccando
e trascinando fuori dal manipolatore
Se cliccate nello schermo, il manipolatore scompare. Per farlo tornare cliccate
su 2 Def nella finestra ad albero per selezionare l'etilene che diventa
giallo. Poi scegliete Edit - Attach Selection to Manipulator,
in questo modo il manipolatore ricompare e potete perfezionare il posizionamento
dell'etilene.
|

fig. 11

fig. 12
|
|
Creare
gli orbitali HOMO e LUMO
Prima di creare gli orbitali HOMO del butadiene e LUMO dell'etilene, dovete
cancellare gli orbitali creati prima.
In Surfaces - Make Surfaces - RHF MOs selezionate gli orbitali uno per uno
e cancellateli con Remove Grid.
Ottimizzate le molecole col metodo PM3. (Calculation
- Optimize Geometry - PM3 - Start) (figura 11).
Se durante l'ottimizzazione le molecole vengono allontanate troppo o vengono
ruotate, tornate ad allinearle col manipolatore fino a portarle come in
figura 11.
Ottimizzate ancora con PM3.
Salvate col nome butadiene_etilene_PM3.
Create gli orbitali HOMO del butadiene e LUMO
dell'etilene: Calculation - Energy - Surface Properties - 17 homo,
19 - OK - Start.
Dovete scegliere l'orbitale 19 che rappresenta il LUMO dell'etilene perchè
il 18 LUMO è il lumo del butadiene
Rappresentate i due orbitali p
sullo schermo : Surfaces - Make Surfaces - RHF MOs. Trascinate l'orbitale
17 nella finestra Grid, scrivete 17 homo nella finestra Surface Name,
cliccate Create>>.
Ripetete l'operazione per l'orbitale 19 che chiamerete 19 lumo.
Il simbolo degli orbitali creati compare nella finestrella a destra. Sceglieteli
e accendeteli con Toggle Display.
I due orbitali verranno mostrati da ArgusLab nella finestra di lavoro (figura
12).
fig. 13 e 14
Per vedere in trasparenza la molecola come nelle due figue qui sopra, scegliete
l'opzione Mesh:
Click destro sull'orbitale - Modify Surface - Mesh.
Da queste immagini è evidente che l'orbitale HOMO del butadiene
si può sovrapporre con l'orbitale LUMO dell'etilene con interazioni
favorevoli di legame su entrambi i lobi (puntini bianchi).
Il lobo blu dell'orbitale HOMO si può sovrapporre col lobo
blu sottostante dell'orbitale LUMO.
Contemporaneamente il lobo rosso dell'orbitale HOMO si può
sovrapporre col lobo rosso sottostante dell'orbitale LUMO come si
vede qui sopra in figura 13. |
|

fig. 15
|
|
Cicloaddizione di etilene e propene
Ripetete queste operazioni con due molecole che non possono dare cicloaddizione
di Diels-Alder, per esempio etilene e propene.
Create le due molecole in finestre diverse.
Copiate una molecola e incollatela nell'altra finestra.
Portatele una sopra l'altra col manipolatore.
Ottimizzate la geometria col metodo PM3.
Create gli orbitali Homo del propene e LUMO dell'etilene.
Otterrete la situazione di figura 15.
Qui si vede che l'orbitale LUMO dell'etilene (in alto) non si può
sovrapporre in modo conveniente con l'orbitale HOMO del propene (in basso).
Si vede infatti che il lobo rosso del LUMO può dare interazioni
di legame col lobo rosso sottostante HOMO, ma il lobo blu del
LUMO dà interazione di antilegame col lobo rosso sottostante
HOMO. (figura 16)
fig. 16
|
|
|
|
Autore: prof
Mauro Tonellato
Per approfondire l'argomento
si veda l'ottimo libro:
Frontier Orbitals and Organic Chemical Reactions - Ian Fleming
|
|
|
|

Chimica
al Computer
PianetaChimica home
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|